Utilizarea concomitentă a sertralinei cu inhibitori ireversibili ai monoaminooxidazei (IMAO) este contraindicată din cauza riscului de sindrom serotoninergic cu simptome precum agitație, tremor și hipertermie. Tratamentul cu sertralină nu trebuie inițiat timp de cel puțin 14 zile după întreruperea tratamentului cu un inhibitor IMAO ireversibil. Sertralina trebuie întreruptă cu cel puțin 7 zile înainte de inițierea tratamentului cu un inhibitor IMAO ireversibil.