Ruxolitinibul este un inhibitor selectiv al kinazelor Janus (JAK) JAK1 și JAK2 (valorile IC50 pentru JAK1 și JAK2 sunt de 3,3 nmol, respectiv 2,8 nmol). Aceste enzime mediază semnalizarea unui număr de citokine și factori de creștere importanți pentru hematopoieză și sistemul imunitar.